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    微生物生態生物信息技術研討會


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    微生物生態生物信息技術研討會

     

      由于微生物個體小、數量大、世代周期短,并且在環境中絕大多數尚不可培養,微生物多樣性研究受到了巨大限制,從而制約了微生物生態學的發展。

      

      近年來,隨著高通量測序等現代分子生物學技術的突破,人們可以從基因水平測定不可培養微生物的群落組成和功能多樣性,使得自 21 世紀以來微生物生態學成為目前微生物學、地理學以及生態學領域*為重要的交叉學科之一。


      當前,高通量測序手段日新月異,主流測序已由 454 轉變為 IlluminaHiSeq 和 MiSeq。然而,龐大數據量的產生為微生物生態學發展帶來新機遇的同時,也帶來了挑戰。海量數據、紛繁復雜的土壤氣候環境變量,使我們在選擇合適的數理統計工具時更加困惑。


      基于此,中國土壤學會已于 2013 年 2 月 25-28 日成功舉辦了“**屆微生物生態研討會暨生物信息分析培訓班”。這次會議使大家對高通量數據分析手段有了更深入的認識,也使大家得到了廣泛的交流。然而,目前紛繁復雜的統計分析工具以及方法選擇還是我們在微生物生態研究的重要阻礙。


      因此,中國土壤學會將于 2015 年 2 月 2 日-4 日舉辦“**屆微生物生態生物信息技術研討會”。會議邀請國內知名微生物生態學家,及美國阿貢國家實驗室 Jack Anthony Gilbert 教授和密歇根州立大學 Ashley Lauren Shade 教授及其團隊作微生物生態領域專題報告,隨后Gilbert 和 Shade 教授及其團隊成員對高通量測序(Illumina HiSeq 和 MiSeq)后續的生物信息分析進行系統講解。



      會議主題:


      1、Illumina Hiseq 的生物信息分析:環境中微生物全基因組的數據分析; MG-RAST 以及云計算在高通量數據分析中的運用;


      2、微生物群落預測模型、代謝模型:Artificial Neural Network (ANN),Microbial AssemblagePrediction(MAP),Predicted Relative Metabolomic Turnover (PRMT),種分布預測模型Species distribution modeling 等在微生物生態上的運用;


      3、Illumina Miseq 測序的生物信息分析:包括如何使用 QIIME 進行數據處理以及在分析中應注意的問題,如何使用 R 和其他分析軟件進行分析統計及制圖-PCA、RDA、DCA、CCA、NMDS、CLUSTER、MNTD 等.


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